Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B2

Ubald1, UBA-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubald1Q6P3B2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubald1Q6P3B2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubald1Q6P3B2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubald1Q6P3B2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubald1Q6P3B2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubald1Q6P3B2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubald1Q6P3B2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubald1Q6P3B2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubald1Q6P3B2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubald1Q6P3B2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubald1Q6P3B2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubald1Q6P3B2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubald1Q6P3B2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubald1Q6P3B2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubald1Q6P3B2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubald1Q6P3B2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubald1Q6P3B2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubald1Q6P3B2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubald1Q6P3B2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubald1Q6P3B2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubald1Q6P3B2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubald1Q6P3B2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubald1Q6P3B2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubald1Q6P3B2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubald1Q6P3B2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubald1Q6P3B2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubald1Q6P3B2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubald1Q6P3B2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubald1Q6P3B2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms