Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Best3Q6H1V1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Best3Q6H1V1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Best3Q6H1V1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Best3Q6H1V1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Best3Q6H1V1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Best3Q6H1V1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Best3Q6H1V1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Best3Q6H1V1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Best3Q6H1V1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Best3Q6H1V1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Best3Q6H1V1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Best3Q6H1V1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Best3Q6H1V1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Best3Q6H1V1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Best3Q6H1V1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Best3Q6H1V1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Best3Q6H1V1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Best3Q6H1V1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Best3Q6H1V1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Best3Q6H1V1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Best3Q6H1V1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Best3Q6H1V1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Best3Q6H1V1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms