Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nckap5lQ6GQX2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nckap5lQ6GQX2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms