Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Smarca2Q6DIC0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Smarca2Q6DIC0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Smarca2Q6DIC0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Smarca2Q6DIC0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Smarca2Q6DIC0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Smarca2Q6DIC0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Smarca2Q6DIC0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Smarca2Q6DIC0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Smarca2Q6DIC0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Smarca2Q6DIC0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Smarca2Q6DIC0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Smarca2Q6DIC0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Smarca2Q6DIC0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Smarca2Q6DIC0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Smarca2Q6DIC0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Smarca2Q6DIC0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Smarca2Q6DIC0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Smarca2Q6DIC0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Smarca2Q6DIC0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Smarca2Q6DIC0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Smarca2Q6DIC0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Smarca2Q6DIC0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Smarca2Q6DIC0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Smarca2Q6DIC0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Smarca2Q6DIC0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Smarca2Q6DIC0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Smarca2Q6DIC0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Smarca2Q6DIC0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Smarca2Q6DIC0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Smarca2Q6DIC0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Smarca2Q6DIC0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Smarca2Q6DIC0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Smarca2Q6DIC0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Smarca2Q6DIC0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Smarca2Q6DIC0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Smarca2Q6DIC0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Smarca2Q6DIC0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Smarca2Q6DIC0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Smarca2Q6DIC0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Smarca2Q6DIC0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
Smarca2Q6DIC0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Smarca2Q6DIC0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
Smarca2Q6DIC0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Smarca2Q6DIC0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Smarca2Q6DIC0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Smarca2Q6DIC0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Smarca2Q6DIC0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Smarca2Q6DIC0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Smarca2Q6DIC0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Smarca2Q6DIC0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Smarca2Q6DIC0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Smarca2Q6DIC0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Smarca2Q6DIC0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Smarca2Q6DIC0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Smarca2Q6DIC0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Smarca2Q6DIC0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Smarca2Q6DIC0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Smarca2Q6DIC0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Smarca2Q6DIC0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Smarca2Q6DIC0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Smarca2Q6DIC0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Smarca2Q6DIC0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Smarca2Q6DIC0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Smarca2Q6DIC0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.9 ms