Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Pram1Q6BCL1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pram1Q6BCL1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pram1Q6BCL1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pram1Q6BCL1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pram1Q6BCL1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pram1Q6BCL1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pram1Q6BCL1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pram1Q6BCL1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pram1Q6BCL1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pram1Q6BCL1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pram1Q6BCL1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pram1Q6BCL1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pram1Q6BCL1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pram1Q6BCL1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pram1Q6BCL1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pram1Q6BCL1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pram1Q6BCL1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pram1Q6BCL1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pram1Q6BCL1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pram1Q6BCL1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pram1Q6BCL1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pram1Q6BCL1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pram1Q6BCL1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pram1Q6BCL1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pram1Q6BCL1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Pram1Q6BCL1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Pram1Q6BCL1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms