Protein–RNA interactions for Protein: Q64455

Ptprj, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, mousemouse

Predictions only

Length 1,238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprjQ64455 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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PtprjQ64455 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprjQ64455 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprjQ64455 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprjQ64455 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprjQ64455 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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PtprjQ64455 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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PtprjQ64455 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprjQ64455 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprjQ64455 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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PtprjQ64455 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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PtprjQ64455 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprjQ64455 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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PtprjQ64455 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprjQ64455 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprjQ64455 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprjQ64455 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprjQ64455 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprjQ64455 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprjQ64455 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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PtprjQ64455 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprjQ64455 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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PtprjQ64455 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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PtprjQ64455 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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PtprjQ64455 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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PtprjQ64455 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtprjQ64455 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtprjQ64455 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtprjQ64455 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtprjQ64455 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprjQ64455 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprjQ64455 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprjQ64455 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprjQ64455 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprjQ64455 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprjQ64455 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprjQ64455 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprjQ64455 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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PtprjQ64455 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms