Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nptx1Q62443 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms