Protein–RNA interactions for Protein: Q61450

Gp49a, Mast cell surface glycoprotein Gp49A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp49aQ61450 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp49aQ61450 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gp49aQ61450 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms