Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Laptm4aQ60961 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Laptm4aQ60961 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Laptm4aQ60961 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Laptm4aQ60961 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Laptm4aQ60961 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Laptm4aQ60961 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Laptm4aQ60961 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Laptm4aQ60961 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Laptm4aQ60961 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Laptm4aQ60961 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Laptm4aQ60961 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Laptm4aQ60961 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Laptm4aQ60961 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Laptm4aQ60961 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Laptm4aQ60961 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Laptm4aQ60961 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Laptm4aQ60961 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Laptm4aQ60961 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Laptm4aQ60961 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Laptm4aQ60961 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Laptm4aQ60961 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Laptm4aQ60961 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Laptm4aQ60961 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Laptm4aQ60961 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Laptm4aQ60961 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Laptm4aQ60961 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Laptm4aQ60961 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Laptm4aQ60961 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Laptm4aQ60961 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Laptm4aQ60961 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Laptm4aQ60961 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Laptm4aQ60961 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Laptm4aQ60961 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Laptm4aQ60961 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Laptm4aQ60961 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Laptm4aQ60961 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms