Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kpna1Q60960 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kpna1Q60960 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms