Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nr2f1Q60632 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms