Protein–RNA interactions for Protein: Q5UKY4

Cd200r3, Cell surface glycoprotein CD200 receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200r3Q5UKY4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd200r3Q5UKY4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd200r3Q5UKY4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms