Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZT6

Zkscan4, MCG23028, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan4Q5SZT6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zkscan4Q5SZT6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zkscan4Q5SZT6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zkscan4Q5SZT6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zkscan4Q5SZT6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Zkscan4Q5SZT6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zkscan4Q5SZT6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zkscan4Q5SZT6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zkscan4Q5SZT6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zkscan4Q5SZT6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Zkscan4Q5SZT6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zkscan4Q5SZT6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zkscan4Q5SZT6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zkscan4Q5SZT6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zkscan4Q5SZT6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zkscan4Q5SZT6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zkscan4Q5SZT6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Zkscan4Q5SZT6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zkscan4Q5SZT6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zkscan4Q5SZT6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zkscan4Q5SZT6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zkscan4Q5SZT6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zkscan4Q5SZT6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Zkscan4Q5SZT6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Zkscan4Q5SZT6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zkscan4Q5SZT6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zkscan4Q5SZT6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zkscan4Q5SZT6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zkscan4Q5SZT6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zkscan4Q5SZT6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zkscan4Q5SZT6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zkscan4Q5SZT6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zkscan4Q5SZT6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zkscan4Q5SZT6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Zkscan4Q5SZT6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Zkscan4Q5SZT6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zkscan4Q5SZT6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zkscan4Q5SZT6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zkscan4Q5SZT6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms