Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYD0

Myo1d, Unconventional myosin-Id, mousemouse

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1dQ5SYD0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Myo1dQ5SYD0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Myo1dQ5SYD0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Myo1dQ5SYD0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Myo1dQ5SYD0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myo1dQ5SYD0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms