Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWD4

Gm20816, Predicted gene, 20816, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20816Q5FWD4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20816Q5FWD4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20816Q5FWD4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20816Q5FWD4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20816Q5FWD4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20816Q5FWD4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20816Q5FWD4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm20816Q5FWD4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20816Q5FWD4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20816Q5FWD4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20816Q5FWD4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20816Q5FWD4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20816Q5FWD4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20816Q5FWD4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20816Q5FWD4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20816Q5FWD4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20816Q5FWD4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20816Q5FWD4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20816Q5FWD4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20816Q5FWD4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20816Q5FWD4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20816Q5FWD4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20816Q5FWD4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20816Q5FWD4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20816Q5FWD4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20816Q5FWD4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20816Q5FWD4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20816Q5FWD4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20816Q5FWD4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20816Q5FWD4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20816Q5FWD4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20816Q5FWD4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20816Q5FWD4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20816Q5FWD4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20816Q5FWD4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms