Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ecm2Q5FW85 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ecm2Q5FW85 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ecm2Q5FW85 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ecm2Q5FW85 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ecm2Q5FW85 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Ecm2Q5FW85 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ecm2Q5FW85 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Ecm2Q5FW85 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ecm2Q5FW85 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Ecm2Q5FW85 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ecm2Q5FW85 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ecm2Q5FW85 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ecm2Q5FW85 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ecm2Q5FW85 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ecm2Q5FW85 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ecm2Q5FW85 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ecm2Q5FW85 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ecm2Q5FW85 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ecm2Q5FW85 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ecm2Q5FW85 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ecm2Q5FW85 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ecm2Q5FW85 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ecm2Q5FW85 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ecm2Q5FW85 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ecm2Q5FW85 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ecm2Q5FW85 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ecm2Q5FW85 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ecm2Q5FW85 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ecm2Q5FW85 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ecm2Q5FW85 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ecm2Q5FW85 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Ecm2Q5FW85 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ecm2Q5FW85 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ecm2Q5FW85 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ecm2Q5FW85 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ecm2Q5FW85 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ecm2Q5FW85 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ecm2Q5FW85 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ecm2Q5FW85 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ecm2Q5FW85 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ecm2Q5FW85 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ecm2Q5FW85 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ecm2Q5FW85 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ecm2Q5FW85 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ecm2Q5FW85 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ecm2Q5FW85 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ecm2Q5FW85 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ecm2Q5FW85 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ecm2Q5FW85 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.3 ms