Protein–RNA interactions for Protein: Q505D1

Ankrd28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28Q505D1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd28Q505D1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd28Q505D1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd28Q505D1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd28Q505D1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd28Q505D1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd28Q505D1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd28Q505D1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd28Q505D1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd28Q505D1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd28Q505D1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd28Q505D1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd28Q505D1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd28Q505D1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd28Q505D1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd28Q505D1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd28Q505D1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd28Q505D1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd28Q505D1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd28Q505D1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd28Q505D1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd28Q505D1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd28Q505D1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd28Q505D1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ankrd28Q505D1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ankrd28Q505D1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ankrd28Q505D1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd28Q505D1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd28Q505D1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd28Q505D1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd28Q505D1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd28Q505D1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd28Q505D1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd28Q505D1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd28Q505D1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd28Q505D1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd28Q505D1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd28Q505D1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd28Q505D1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd28Q505D1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd28Q505D1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms