Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Xirp2Q4U4S6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xirp2Q4U4S6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms