Protein–RNA interactions for Protein: Q497J0

BC100530, MCG130175, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC100530Q497J0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC100530Q497J0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC100530Q497J0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC100530Q497J0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC100530Q497J0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC100530Q497J0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC100530Q497J0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC100530Q497J0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC100530Q497J0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC100530Q497J0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC100530Q497J0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC100530Q497J0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC100530Q497J0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC100530Q497J0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC100530Q497J0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC100530Q497J0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC100530Q497J0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC100530Q497J0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC100530Q497J0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC100530Q497J0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BC100530Q497J0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC100530Q497J0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BC100530Q497J0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC100530Q497J0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC100530Q497J0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC100530Q497J0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC100530Q497J0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC100530Q497J0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC100530Q497J0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC100530Q497J0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC100530Q497J0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC100530Q497J0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC100530Q497J0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
BC100530Q497J0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC100530Q497J0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms