Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa20Q45VN2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa20Q45VN2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa20Q45VN2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa20Q45VN2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Defa20Q45VN2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Defa20Q45VN2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Defa20Q45VN2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Defa20Q45VN2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Defa20Q45VN2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Defa20Q45VN2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa20Q45VN2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms