Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnah12Q3V0Q1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnah12Q3V0Q1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnah12Q3V0Q1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnah12Q3V0Q1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnah12Q3V0Q1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Dnah12Q3V0Q1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Dnah12Q3V0Q1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnah12Q3V0Q1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnah12Q3V0Q1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnah12Q3V0Q1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnah12Q3V0Q1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnah12Q3V0Q1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnah12Q3V0Q1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnah12Q3V0Q1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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Dnah12Q3V0Q1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnah12Q3V0Q1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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Dnah12Q3V0Q1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Dnah12Q3V0Q1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnah12Q3V0Q1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnah12Q3V0Q1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnah12Q3V0Q1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnah12Q3V0Q1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Dnah12Q3V0Q1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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Dnah12Q3V0Q1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnah12Q3V0Q1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnah12Q3V0Q1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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Dnah12Q3V0Q1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnah12Q3V0Q1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnah12Q3V0Q1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnah12Q3V0Q1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnah12Q3V0Q1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnah12Q3V0Q1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnah12Q3V0Q1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnah12Q3V0Q1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnah12Q3V0Q1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnah12Q3V0Q1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnah12Q3V0Q1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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Dnah12Q3V0Q1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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Dnah12Q3V0Q1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnah12Q3V0Q1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnah12Q3V0Q1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnah12Q3V0Q1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnah12Q3V0Q1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnah12Q3V0Q1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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Dnah12Q3V0Q1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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Dnah12Q3V0Q1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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Dnah12Q3V0Q1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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Dnah12Q3V0Q1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms