Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrrc43Q3V0L5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrrc43Q3V0L5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc43Q3V0L5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc43Q3V0L5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms