Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E330034G19RikQ3UWX6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms