Protein–RNA interactions for Protein: Q3USF0

B3gnt6, Acetylgalactosaminyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3gnt6Q3USF0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B3gnt6Q3USF0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B3gnt6Q3USF0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms