Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf48Q3US17 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms