Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms