Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms