Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc34Q3UI66 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms