Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otud5Q3U2S4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otud5Q3U2S4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otud5Q3U2S4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms