Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ccdc136Q3TVA9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ccdc136Q3TVA9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Ccdc136Q3TVA9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Ccdc136Q3TVA9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Ccdc136Q3TVA9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Ccdc136Q3TVA9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
Ccdc136Q3TVA9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Ccdc136Q3TVA9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Ccdc136Q3TVA9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Ccdc136Q3TVA9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Ccdc136Q3TVA9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Ccdc136Q3TVA9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ccdc136Q3TVA9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ccdc136Q3TVA9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ccdc136Q3TVA9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ccdc136Q3TVA9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ccdc136Q3TVA9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ccdc136Q3TVA9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ccdc136Q3TVA9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ccdc136Q3TVA9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ccdc136Q3TVA9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ccdc136Q3TVA9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ccdc136Q3TVA9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ccdc136Q3TVA9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ccdc136Q3TVA9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ccdc136Q3TVA9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ccdc136Q3TVA9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ccdc136Q3TVA9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ccdc136Q3TVA9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ccdc136Q3TVA9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ccdc136Q3TVA9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ccdc136Q3TVA9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ccdc136Q3TVA9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ccdc136Q3TVA9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ccdc136Q3TVA9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ccdc136Q3TVA9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Ccdc136Q3TVA9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Ccdc136Q3TVA9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Ccdc136Q3TVA9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Ccdc136Q3TVA9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ccdc136Q3TVA9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ccdc136Q3TVA9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ccdc136Q3TVA9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ccdc136Q3TVA9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Ccdc136Q3TVA9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Ccdc136Q3TVA9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Ccdc136Q3TVA9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Ccdc136Q3TVA9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Ccdc136Q3TVA9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Ccdc136Q3TVA9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ccdc136Q3TVA9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ccdc136Q3TVA9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ccdc136Q3TVA9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ccdc136Q3TVA9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ccdc136Q3TVA9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ccdc136Q3TVA9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ccdc136Q3TVA9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ccdc136Q3TVA9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ccdc136Q3TVA9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ccdc136Q3TVA9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ccdc136Q3TVA9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms