Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC93

Hs1bp3, HCLS1-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs1bp3Q3TC93 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hs1bp3Q3TC93 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hs1bp3Q3TC93 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hs1bp3Q3TC93 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hs1bp3Q3TC93 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hs1bp3Q3TC93 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hs1bp3Q3TC93 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hs1bp3Q3TC93 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hs1bp3Q3TC93 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Hs1bp3Q3TC93 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hs1bp3Q3TC93 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hs1bp3Q3TC93 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hs1bp3Q3TC93 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hs1bp3Q3TC93 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hs1bp3Q3TC93 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hs1bp3Q3TC93 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hs1bp3Q3TC93 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hs1bp3Q3TC93 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hs1bp3Q3TC93 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hs1bp3Q3TC93 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hs1bp3Q3TC93 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hs1bp3Q3TC93 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Hs1bp3Q3TC93 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hs1bp3Q3TC93 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hs1bp3Q3TC93 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hs1bp3Q3TC93 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hs1bp3Q3TC93 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hs1bp3Q3TC93 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hs1bp3Q3TC93 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hs1bp3Q3TC93 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hs1bp3Q3TC93 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hs1bp3Q3TC93 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hs1bp3Q3TC93 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hs1bp3Q3TC93 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hs1bp3Q3TC93 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hs1bp3Q3TC93 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hs1bp3Q3TC93 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hs1bp3Q3TC93 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hs1bp3Q3TC93 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Hs1bp3Q3TC93 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hs1bp3Q3TC93 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms