Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cpne9Q1RLL3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpne9Q1RLL3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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