Protein–RNA interactions for Protein: Q1HDU4

Arhgap9, ArhGAP9, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap9Q1HDU4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap9Q1HDU4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap9Q1HDU4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap9Q1HDU4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap9Q1HDU4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap9Q1HDU4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap9Q1HDU4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap9Q1HDU4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap9Q1HDU4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap9Q1HDU4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap9Q1HDU4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap9Q1HDU4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap9Q1HDU4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arhgap9Q1HDU4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arhgap9Q1HDU4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arhgap9Q1HDU4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arhgap9Q1HDU4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arhgap9Q1HDU4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arhgap9Q1HDU4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arhgap9Q1HDU4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arhgap9Q1HDU4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arhgap9Q1HDU4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arhgap9Q1HDU4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arhgap9Q1HDU4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arhgap9Q1HDU4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arhgap9Q1HDU4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arhgap9Q1HDU4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arhgap9Q1HDU4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arhgap9Q1HDU4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arhgap9Q1HDU4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arhgap9Q1HDU4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arhgap9Q1HDU4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap9Q1HDU4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms