Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myo3bQ1EG27 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Myo3bQ1EG27 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Myo3bQ1EG27 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms