Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spata18Q0P557 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spata18Q0P557 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spata18Q0P557 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spata18Q0P557 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spata18Q0P557 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spata18Q0P557 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spata18Q0P557 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spata18Q0P557 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spata18Q0P557 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spata18Q0P557 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Spata18Q0P557 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spata18Q0P557 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Spata18Q0P557 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spata18Q0P557 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Spata18Q0P557 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spata18Q0P557 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spata18Q0P557 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spata18Q0P557 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spata18Q0P557 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spata18Q0P557 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spata18Q0P557 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spata18Q0P557 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spata18Q0P557 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spata18Q0P557 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Spata18Q0P557 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spata18Q0P557 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spata18Q0P557 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spata18Q0P557 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spata18Q0P557 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Spata18Q0P557 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spata18Q0P557 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spata18Q0P557 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spata18Q0P557 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spata18Q0P557 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spata18Q0P557 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spata18Q0P557 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spata18Q0P557 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spata18Q0P557 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spata18Q0P557 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spata18Q0P557 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Spata18Q0P557 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spata18Q0P557 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spata18Q0P557 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spata18Q0P557 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spata18Q0P557 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spata18Q0P557 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spata18Q0P557 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spata18Q0P557 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spata18Q0P557 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spata18Q0P557 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spata18Q0P557 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spata18Q0P557 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms