Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnn2Q08093 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms