Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emx1Q04742 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms