Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms