Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vgll3P85442 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms