Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irx3P81067 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irx3P81067 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Irx3P81067 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irx3P81067 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irx3P81067 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irx3P81067 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irx3P81067 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irx3P81067 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irx3P81067 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Irx3P81067 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Irx3P81067 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Irx3P81067 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Irx3P81067 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Irx3P81067 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms