Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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Ptprn2P80560 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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Ptprn2P80560 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ptprn2P80560 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptprn2P80560 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptprn2P80560 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptprn2P80560 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptprn2P80560 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Ptprn2P80560 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptprn2P80560 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptprn2P80560 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Ptprn2P80560 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptprn2P80560 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptprn2P80560 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptprn2P80560 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Ptprn2P80560 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Ptprn2P80560 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptprn2P80560 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptprn2P80560 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptprn2P80560 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptprn2P80560 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptprn2P80560 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptprn2P80560 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptprn2P80560 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptprn2P80560 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptprn2P80560 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Ptprn2P80560 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Ptprn2P80560 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
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Ptprn2P80560 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Ptprn2P80560 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms