Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gjb6P70689 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gjb6P70689 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gjb6P70689 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gjb6P70689 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gjb6P70689 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb6P70689 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb6P70689 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb6P70689 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb6P70689 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb6P70689 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb6P70689 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb6P70689 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb6P70689 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb6P70689 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb6P70689 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb6P70689 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb6P70689 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb6P70689 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb6P70689 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb6P70689 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb6P70689 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb6P70689 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb6P70689 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb6P70689 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb6P70689 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb6P70689 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb6P70689 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb6P70689 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb6P70689 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb6P70689 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gjb6P70689 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb6P70689 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb6P70689 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb6P70689 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb6P70689 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb6P70689 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb6P70689 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb6P70689 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb6P70689 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb6P70689 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb6P70689 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb6P70689 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb6P70689 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gjb6P70689 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb6P70689 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gjb6P70689 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb6P70689 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb6P70689 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb6P70689 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb6P70689 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gjb6P70689 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjb6P70689 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjb6P70689 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjb6P70689 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjb6P70689 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjb6P70689 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms