Protein–RNA interactions for Protein: P62852

Rps25, 40S ribosomal protein S25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps25P62852 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps25P62852 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps25P62852 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps25P62852 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps25P62852 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps25P62852 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps25P62852 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps25P62852 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps25P62852 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps25P62852 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps25P62852 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps25P62852 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps25P62852 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps25P62852 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps25P62852 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps25P62852 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps25P62852 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps25P62852 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps25P62852 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps25P62852 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps25P62852 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps25P62852 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps25P62852 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps25P62852 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps25P62852 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps25P62852 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps25P62852 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rps25P62852 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps25P62852 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps25P62852 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps25P62852 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms