Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra1P62812 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms