Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vsnl1P62761 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms