Protein–RNA interactions for Protein: P61021

Rab5b, Ras-related protein Rab-5B, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5bP61021 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab5bP61021 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms