Protein–RNA interactions for Protein: P60603

Romo1, Reactive oxygen species modulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Romo1P60603 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Romo1P60603 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Romo1P60603 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Romo1P60603 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Romo1P60603 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms