Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pcmtd1P59913 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms