Protein–RNA interactions for Protein: P57748

Mmp20, Matrix metalloproteinase-20, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp20P57748 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mmp20P57748 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mmp20P57748 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp20P57748 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp20P57748 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp20P57748 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp20P57748 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp20P57748 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp20P57748 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp20P57748 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp20P57748 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp20P57748 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp20P57748 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mmp20P57748 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms