Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp25P57080 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp25P57080 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp25P57080 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp25P57080 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp25P57080 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp25P57080 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp25P57080 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp25P57080 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Usp25P57080 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp25P57080 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 200.9 ms